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CompuCell3D 3.7.6 Revision 20170723

CompuCell3D - Un logiciel efficace et simple conçu pour vous aider à visualiser et à concevoir des modèles moléculaires 3D avancés

Un logiciel efficace et simple conçu pour vous aider à visualiser et à concevoir des modèles moléculaires 3D avancés

La modélisation moléculaire est une incursion scientifique fascinante dans les profondeurs de l'organisme humain, ce qui peut apporter des réponses importantes à certaines de nos questions les plus fondamentales. Heureusement, les scientifiques ont profité grandement de l'augmentation constante du pouvoir informatique, car de plus en plus d'applications sont consacrées à les aider à démêler les mystères biologiques. CompuCell3D n'est qu'un programme de ce genre qui peut être utilisé par des professionnels hautement qualifiés pour simuler et modéliser avec précision le comportement des cellules.

L'utilité scientifique emploie des modèles cellulaires de Potts, en particulier des algorithmes de Glazier-Graner-Hogeweg (GGH) pour modéliser et décrire le comportement de tissus, d'organes ou d'organismes à une ou plusieurs cellules. Cette approche basée sur le réseau garantit que les modèles sont exactement résolus et les simulations générées et les représentations cellulaires s'adaptent adéquatement aux mécanismes actuels.

La création d'une simulation exige que les utilisateurs définissent les cellules réelles, ainsi que la conception de leurs interactions. Ceci est effectué en définissant de nouvelles propriétés aux entrées dans "Éditeur de modèle". Tout comme pour tout environnement de programmation, les scientifiques peuvent ajuster toutes les propriétés des éléments de simulation, y compris les dimensions physiques, les volumes et les types de cellules.

Pour que toute recherche viable se produise, il faut aussi définir l'amplitude des fluctuations et le degré de variation. La configuration initiale des cellules doit également être définie et les utilisateurs peuvent importer ces derniers éléments à partir de tous les fichiers de données simples. Une fois toutes ces étapes terminées, la simulation se fait en cliquant simplement sur le bouton "Exécuter".

Cependant, des utilisateurs plus compétents pour la technologie trouveront le support de l'application pour les scripts Python et les extensions C ++ très précieux, car il permet de construire des modèles biologiques plus sophistiqués et précis. Au cours de la simulation, des captures d'écran peuvent être prises et on peut également générer des fichiers PIF à partir des sorties VTK.

En tout, CompuCell3D est une solution puissante pour toute personne active dans le domaine de la modélisation biologique, au niveau de la cellule. L'algorithme GGH est utilisé pour modéliser les tissus ou les organismes à une ou plusieurs cellules de manière précise et les utilisateurs avancés peuvent également insérer des scripts Python pour générer des analyses améliorées.

CompuCell3D Details

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