Cytoscape 3.5.0

Cytoscape - Voir et analyser les réseaux d'interactions moléculaires.

Voir et analyser les réseaux d'interactions moléculaires.

Cytoscape est une plateforme logicielle complète bio-informatique conçu pour voir des voies biologiques et des réseaux d'interactions moléculaires.

L'application peut également intégrer ces réseaux avec des annotations, des profils d'expression des gènes et des données d'état d'autres. Bien que Cytoscape a été initialement conçu pour la recherche biologique, il est maintenant une plate-forme générale pour l'analyse des réseaux complexes et la visualisation.

Cytoscape supporte un grand nombre de réseau standard et les formats de fichiers d'annotation, y compris: SIF (Format Interaction simple), GML, XGMML, BioPAX, PSI-MI, SBML, OBO, et Gene Association.

Fichiers texte délimités et classeurs Microsoft Excel sont également pris en charge et vous pouvez importer des fichiers de données, tels que les profils d'expression ou GO, annotations générées par d'autres applications ou les tableurs.

Vous pouvez exporter des réseaux comme images de haute qualité. Le logiciel prend en charge PDF, EPS, SVG, PNG, JPEG et BMP.

Caractéristiques Cytoscape:

- Filtrer le réseau pour sélectionner des sous-ensembles de nœuds et / ou des interactions fondées sur les données actuelles.
- Trouver des sous-réseaux actifs / modules voie.
- Zoom avant / arrière et vous déplacer pour naviguer sur le réseau.
- D'exportation d'images
- Les données du réseau personnaliser l'affichage grâce à de puissantes styles visuels.
- Réseaux de mise en page en deux dimensions
- Depuis Cytoscape supporte l'import / export de fichiers standard formats, vous pouvez facilement mettre Cytoscape dans votre flux de travail.

Cytoscape Details

  • La taille du fichier:
    127 Mb
  • Catégorie:
  • Vidéo:
    Vidéo non disponible
  • Captures d'écran:
  • Téléchargements:
    353
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