Cytoscape 3.7.0

Cytoscape - Voir et analyser les réseaux d'interactions moléculaires.

Voir et analyser les réseaux d'interactions moléculaires.

Cytoscape est une plateforme logicielle complète bio-informatique conçu pour voir des voies biologiques et des réseaux d'interactions moléculaires.

L'application peut également intégrer ces réseaux avec des annotations, des profils d'expression des gènes et des données d'état d'autres. Bien que Cytoscape a été initialement conçu pour la recherche biologique, il est maintenant une plate-forme générale pour l'analyse des réseaux complexes et la visualisation.

Cytoscape supporte un grand nombre de réseau standard et les formats de fichiers d'annotation, y compris: SIF (Format Interaction simple), GML, XGMML, BioPAX, PSI-MI, SBML, OBO, et Gene Association.

Fichiers texte délimités et classeurs Microsoft Excel sont également pris en charge et vous pouvez importer des fichiers de données, tels que les profils d'expression ou GO, annotations générées par d'autres applications ou les tableurs.

Vous pouvez exporter des réseaux comme images de haute qualité. Le logiciel prend en charge PDF, EPS, SVG, PNG, JPEG et BMP.

Caractéristiques Cytoscape:

- Filtrer le réseau pour sélectionner des sous-ensembles de nœuds et / ou des interactions fondées sur les données actuelles.
- Trouver des sous-réseaux actifs / modules voie.
- Zoom avant / arrière et vous déplacer pour naviguer sur le réseau.
- D'exportation d'images
- Les données du réseau personnaliser l'affichage grâce à de puissantes styles visuels.
- Réseaux de mise en page en deux dimensions
- Depuis Cytoscape supporte l'import / export de fichiers standard formats, vous pouvez facilement mettre Cytoscape dans votre flux de travail.

Cytoscape Details

  • La taille du fichier:
    168 Mb
  • Catégorie:
  • Vidéo:
    Vidéo non disponible
  • Captures d'écran:
  • Téléchargements:
    408
Autres téléchargements associés
TxPlan 3.2
Créer des plans de fréquences simples de transpondeur et les enregistrer sous forme d'images à l'aide de cette solution facile à utiliser de logiciel qui prend en charge les fichiers CSV et TSV
154
JChem Suite 18.9.0
Créer, modifier et partager des documents universitaires ou des projets qui impliquent des données chimiques en utilisant les multiples outils disponibles avec ce logiciel bundle
105
IrriPro 4.1.0
Un logiciel de pointe et innovantes capables de facilement concevoir un système d'irrigation de toute taille et complexité.
2,742
Planetary Aspects and Transits 20.02t
Vous pouvez découvrir des transits mondiaux et personnels de corps célestes à l'aide de la carte du ciel et de la table d'affichage, peu importe si vous êtes un amateur ou un professionnel
59
Asynx Planetarium 2.80
Lire des informations sur la position des planètes, les constellations et la phase de lune en fonction des jours de l'année.
115
Open Visual Trace Route 1.7.1
Java carte de navigation du monde.
357
PyMCA 5.4.2
Ensemble d'applications mettant en oeuvre la plupart des besoins d'analyse aux rayons X des données de fluorescence.
227
Fritzing 0.9.3b
Une initiative open-source pour soutenir les concepteurs, les artistes, les chercheurs et les amateurs de prendre l'étape du prototypage physique produit réel.
1,443
Apriori 6.23
Implémentation de l'algorithme Apriori.
428
VEGA ZZ 3.1.0.21
Une application de modélisation moléculaire complet et facile à utiliser.
106