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PDB2PQR 1.8

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PDB2PQR - Convertissez vos fichiers PDF en PQR.

Convertissez vos fichiers PDF en PQR.

Pdb2pqr est conçu comme une application Python qui automatise la plupart des tâches courantes de la préparation de structures pour les calculs de l'électrostatique des milieux continus.

Pdb2pqr est un utilitaire indépendant de la plateforme pour convertir les fichiers au format PDB protéines au format PQR.

Les tâches prévues comprennent:
- Ajout d'un nombre limité de disparus atomes lourds pour des structures biomoléculaires,
- Détermination des pKa des chaînes latérales,
- Mise en place hydrogènes manquants,
- Optimisation de la protéine de liaison hydrogène favorable,
- Attribution de charge et des paramètres de rayon à partir d'une variété de champs de force.

Caractéristiques pdb2pqr:

Interface Web pour APBS avec visualisation en ligne -
- Prise en charge des calculs de pKa et la structure biomoléculaire d'achèvement

exigences:

- Python

PDB2PQR Details

  • La taille du fichier:
    6.5 Mb
  • Catégorie:
  • Vidéo:
    Vidéo non disponible
  • Captures d'écran:
    Images pas disponible
  • Téléchargements:
    234
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