UGENE 1.15.1

UGENE - Une analyse génome suite complète qui dispose alignement de séquences multiples et un constructeur de HMM complexe et module de recherche.

Une analyse génome suite complète qui dispose alignement de séquences multiples et un constructeur de HMM complexe et module de recherche.

UGENE est un outil pratique qui offre également une expérience génome navigation visuelle et interactive.

Caractéristiques principales:

     Alignement de séquences multiples utilisant MUSCLE MUSCLE 3 et 4;
     HMM profils construire et la recherche, sur la base de la source de HMMER 2 et HMMER 3;
     Les amorces PCR web conçu en utilisant Primer 3;
     Prévision protéine de structure secondaire en utilisant GOR IV et PSIPRED;
     Recherche pour les enzymes et l'intégration avec REBASE restriction;
     Trouveur de répétition extrêmement rapide;
     Recherche pour les sites utilisant SITECON liaison du facteur de transcription;
     Finder ORF;
     Complet de Smith-Waterman mise en oeuvre de l'algorithme.
     Visualisation chromatogrammes;
     Visionneuse 3D pour les fichiers dans des formats PDB et MMDB;
     Multiple éditeur d'alignement de séquence;
     Facile à utiliser concepteur de workflow pour les workflows de calcul personnalisé.
     Support complet des processeurs multicœurs modernes et instructions SSE;
     Sur le support des GPU modernes utilisant NVIDIA CUDA et ATI Stream case;
     Des solutions intégrées pour Cell Broadband Engine;
     Solutions privées pour supercalculateurs et l'informatique distribuée.

UGENE Details

  • La taille du fichier:
    10.3 Mb
  • Catégorie:
  • Vidéo:
    Vidéo non disponible
  • Captures d'écran:
  • Téléchargements:
    178
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